Hyppää sisältöön

Significant changes to Puhti & Mahti authentication coming in April! Read about the SSH key and multi-factor authentication requirements.

Väliaikaisen PostgreSQL-tietokannan ajaminen SD Desktopissa

  1. Pyydä pääsyä tools-for-sd-connect -työkaluihin tai lataa oma PostgreSQL-singuaarisuuskonttisi SD Connectiin. Käynnistä SD Desktop -virtuaalikone, jolla on riittävän suuri tietomäärä levytilasta dataa varten. Kirjaudu sisään SD Desktopiin, avaa Data Gateway -yhteys SD Connectiin ja avaa pääteistunto.

  2. Luo pääteistunnossa hakemisto /media/volume/psql ja siirry sinne

    mkdir /media/volume/psql
cd /media/volume/psql

  3. Tuo Apptainer-säilö, joka sisältää PostgreSQL:n

    cp $HOME/Projects/SD\ connect/*/tools-for-sd-desktop/apptainer/postgres_14.2-alpine3.15.sif ./

  4. Luo ympäristötiedosto PostgreSQL:lle (pg.env), jota käytetään.

    module load nano
nano pg.env

  5. Lisää tiedostoon seuraavat asetukset

    export TZ=Europe/Helsinki
export POSTGRES_USER=pguser
export POSTGRES_PASSWORD=pg123
export POSTGRES_DB=mydb
export POSTGRES_INITDB_ARGS="--encoding=UTF-8"

    Tallenna sitten ja poistu nanosta.

  6. Luo hakemistot PostgreSQL-palvelimelle

    mkdir pgdata
mkdir pgrun

  7. Käynnistä screen-istunto pääteistunnossasi ja käynnistä tietokantapalvelin käyttämällä säilöä:

    screen
apptainer run -B pgdata:/var/lib/postgresql/data -B pgrun:/var/run/postgresql -e -C --env-file pg.env postgres_14.2-alpine3.15.sif

    Jätä sitten screen-istunto painamalla:

    Ctrl-a-d

    Palvelimen pitäisi nyt jatkaa käyntiään screen-istunnossa.

  8. Avaa komentorivistunto PostgreSQL-säilöön. Muista kiinnittää hakemisto, jossa datasi sijaitsee (esim. /shared-directory)

    apptainer shell -B /shared-directory:/shared-directory postgres_14.2-alpine3.15.sif

    Kontissa, siirry datakansioosi ja aloita työskentely tietokantasi kanssa:

    cd /shared-directory
psql -h localhost -p 5432 -d mydb -U pguser

    Esimerkiksi

    psql -h localhost -p 5432 -d mydb -U pguser -f psql_dump_file.sql