Opetusohjelmat

Yleiset

• Superlaskennan aloittaminen CSC:llä
• Helmiin tutustuminen
• Datan hallinta Puhti- ja Mahti-työlevyillä
• CSC pikaopas (pdf)
• Linuxin perusteet CSC:lle
• Interaktiivinen ja erätöiden käytännön harjoittelu Puhtissa
• csc-env-komennon käyttö
• Skriptaaminen etänä
• CSC:n HPC-ympäristön tehokas käyttö
• Konttien ajo Puhdissa
• Levytilan käyttö Lue-työkalulla
• Julia-töiden suorittaminen Puhti- ja Mahti-klustereilla
• Pythonin käyttö CSC:n supertietokoneilla
• SSH-avainten asettaminen CSC:llä

Työkalujen asentaminen supertietokoneille

• Ohjelmiston asentaminen Spackilla
• Singularity-konttien rakentaminen tyhjästä
• Conda parhaat käytännöt

Suorituskyky ja korkean läpäisyn työnkulut

• Yleiset korkean läpäisyn ohjeet
• Rinnakkaisen I/O:n optimointi
• Dask & rinnakkainen Python
• HyperQueue meta-ajoitus
• FireWorks työnkulkumalli
• Kuinka ajaa monia lyhyitä tehtäviä GNU Parallelilla
• Nextflow-putkistojen suorittaminen
• Snakemake-putkistojen ajaminen Puhdissa

Allas

• Allaksen käyttö interaktiivisesti Puhdissa ja Mahtissa
• Allaksen käyttö erätöissä
• Allas datasetin isännöiminen tutkimusprojektille
• Työkalut asiakaspuolen salaukseen Allakselle
• Allaksen käyttö LUMI-supertietokoneelta

Bioinformatiikka

• Pakettien asentaminen Biocondasta Tykkyllä
• Singularityn sovellukset Puhdissa
• MaxQuantin suorittaminen Puhdissa
• Schrödinger Maestro Puhti edistynyt opetusohjelma
• Schrödingerin GPU-tehostettu Molport-tietokannan seulonta
• Ensimmäisen työsi ajaminen Puhdissa

Kemia

• Kvanttikemian töiden viljely HyperQueue:lla
• Gabeditin käyttö Gaussian-töille Puhdissa
• Korkean läpäisyn laskenta GROMACS:lla
• Laskennallisen kemian kevätkoulu

Datanalyysi ja koneoppiminen

• Datanalyysiopas
• Koneoppimisopas
• RStudion tai Jupyter-muistikirjojen käyttö Puhdissa
• Parallel R:n aloittaminen

Geoinformatiikka

• Johdatus geolaskentaan CSC:n laskentaympäristössä
• Earth Observation (EO) opas
• Geospatiaalisten tiedostojen käyttö pilvestä, mukaan lukien Allas
• GDAL opetusohjelma
• Virtuaaliset rasterit
• Ohjelmakohtaiset opetusohjelmat ja esimerkit löydät vastaavilta ohjelmistosivuilta

Pouta - pilvipalvelu

Poutan opetusohjelmat löydät kohdasta Pilvipalvelut > Pouta > Opetusohjelmat

Pukki - tietokantapilvi

• PostgreSQL-tietokannan siirtäminen Pukkiin

Rahti - konttipilvi

Rahtin opetusohjelmat löydät kohdasta Pilvipalvelut > Rahti > Opetusohjelmat

Herkät tiedot

• Herkän datan kuljettaminen Allaksella
• Tilapäisen PostgreSQL-tietokannan ajaminen SD Desktopissa

Visualisointi

• Blenderin opetusohjelma

CSC Resurssit Kursseille

• Puhti-verkkoliittymädemo kurssinjärjestäjille
• Noppe-ympäristö mukautettujen muistikirjojen luomiseen

Onko tämä sivu hyödyllinen?

Kyllä

Kiitos palautteestasi!

Ei

Kiitos! Arvostamme palautettasi.

Please let us know how we could improve this page by contacting us or by creating an issue in GitHub. You can also edit this page yourself and contribute your improvements by creating a pull request.